Für eine ganze Reihe von Programmen ist die Unterstützung von S/MIME bereits integriert. Bei Älteren Programmversionen oder bei der Nutzung von PrettyGoodPrivacy muß zusätzliche Software installiert werden. Zur Integration der Software für Kryptographie, muß zuerst die Installation der Programme vorgenommen, und danach die Konfiguration der Programme durchgeführt werden, mit denen die Verschlüsselung von Dateien und Nachrichten abgewickelt werden soll. Die Installationsroutinen der Programme übernehmen diese Aufgeben
Bei vielen eMail-Programmen ist S/MIME bereits vorinstalliert verfügbar, wogegen für OpenPGP eine Installaion erfordert die unter Mac OSX oftmals nach einer Aktualisierung von Apples eMail-Client Mail.app erneut vorgenommen werden muß.